Megpróbálta telepíteni a gromacokat 5.1.1 a homebrew segítségével, az összes parancs nem található

1. Hogyan telepíthetem a Gromacs legújabb verzióját?
2. Hogyan tölthetem le és telepíthetem a Gromacs-ot?
3. Hogyan telepíthetem a Gromacs-ot a Windows 10 rendszerre?
4. Hogyan futtathatom a Gromacsot Linux alatt?
5. Mi a Gromacs legújabb verziója?
6. Hogyan ellenőrizhetem a Gromacs verziót?
7. Hogyan telepítsem a Gromacs-ot?
8. Hogyan tölthetem le és telepíthetem a Cmake alkalmazást?
9. Hogyan telepítsem a Gromacsot GPU támogatással?
10. Hogyan tölthetem le a Gromacsot Linux alatt?
11. Hogyan használja a Gromacsot?
12. Hogyan lehet eltávolítani a Gromacs Linuxot?

Hogyan telepíthetem a Gromacs legújabb verzióját?

Alternatív megoldásként letöltheti és kicsomagolhatja a GROMACS regressziós tesztcsomagot: https: // ftp.gromacs.org / regressziós tesztek / regressziós tesztek-2021.2.kátrány.gz tarball magad, és a haladó REGREESSIONTEST_PATH cmake opcióval add meg a kicsomagolt tarball elérési útját, amelyet a teszteléshez használunk.

Hogyan tölthetem le és telepíthetem a Gromacs-ot?

Alternatív megoldásként letöltheti és kicsomagolhatja a GROMACS regressziós tesztcsomagot: http: // gerrit.gromacs.org / letöltés / regressziós tesztek-2020.kátrány.gz tarball magad, és a haladó REGREESSIONTEST_PATH cmake opcióval add meg a kicsomagolt tarball elérési útját, amelyet a teszteléshez használunk.

Hogyan telepíthetem a Gromacs-ot a Windows 10 rendszerre?

Eljárás

1. Töltse le a GROMACS forráskódot, és csomagolja ki valahova.
2. Futtassa a CMake GUI-t.
3. Állítsa be a forráskód könyvtárat a "Hol van a forráskód" mezőben ...
4. Adjon meg egy másik helyet, ahol az épített GROMACS-t a "Hol lehet építeni a bináris fájlokat" mezőbe kell helyezni ...
5. Kattintson a Konfigurálás elemre. ...
6. A konfigurálás leáll, mert nem találja az FFTW-t.

Hogyan futtathatom a Gromacsot Linux alatt?

Futtassa a bemeneti fájlt (.

A következő lépés a molekuláris struktúra (gro fájl), a topológia (felső fájl) MD-paraméterek (mdp fájl) és (opcionálisan) az index fájl (ndx) egyesítése egy futtatott bemeneti fájl (tpr kiterjesztés) létrehozásához. Ez a fájl tartalmazza a GROMACS-szal történő szimuláció megkezdéséhez szükséges összes információt.

Mi a Gromacs legújabb verziója?

GROMACS

Hogyan ellenőrizhetem a Gromacs verziót?

Csak írja be a "pdb2gmx" szót a terminálba, ahol megismerheti az összes szükséges információt.

Hogyan telepítsem a Gromacs-ot?

Alternatív megoldásként letöltheti és kicsomagolhatja a GROMACS regressziós tesztcsomagot: http: // gerrit.gromacs.org / letöltés / regressziós tesztek-5.1.4.kátrány.gz tarball magad, és a haladó REGREESSIONTEST_PATH cmake opcióval add meg a kicsomagolt tarball elérési útját, amelyet a teszteléshez használunk.

Hogyan tölthetem le és telepíthetem a Cmake alkalmazást?

II- A CMake telepítése

Töltse le a Windows rendszert (WIN32 telepítő). Kap egy cmake-version-win32-x86 nevű fájlt.alkalmazás. Futtassa és kövesse a telepítési folyamatot. Ügyeljen arra, hogy a CMake hozzáadása a rendszer útvonalához opciót válassza.

Hogyan telepítsem a Gromacsot GPU támogatással?

A CUDA eszköztár letöltése

Most innen válassza ki a rendszerének megfelelő CUDA eszköztár legújabb verzióját. Töltse le a helyi futtatási fájlt a következő paranccsal. A futtató fájl tartalmazza az összes telepítendő lényeges komponenst. Váltson arra a könyvtárra, ahová a telepítőt le szeretné tölteni.

Hogyan tölthetem le a Gromacsot Linux alatt?

1. Elkezdeni. Ha frissen telepítette az Ubuntut, ne felejtse el frissíteni a lerakat adatait és a szoftvercsomagokat a rendszerben. ...
2. Telepítés. A Gromacs telepítésének első lépése a cmake megszerzése. A terminálba írja be: sudo apt-get install cmake. ...
3. Egyszerű módszer. ...
4. Rendszeres telepítés.

Hogyan használja a Gromacsot?

A GROMACS kezdeti beállító eszköz a PDB bemenet segítségével három fájlt hoz létre, amelyekre szükség lesz az MD szimulációhoz.
...
Beállít

1. hozzon létre egy 'topológia' fájlt.
2. konvertálja a PDB fehérje szerkezetét GRO fájlba, a struktúra középpontjában egy szimulációs dobozban (egységsejt)
3. hozzon létre helyzetmegtartó fájlt.

Hogyan lehet eltávolítani a Gromacs Linuxot?

A csomag eltávolításához egyszerűen használhatja az apt parancsot, és eltávolíthatja a csomagot a Linux operációs rendszerből. Ez eltávolítja a gromacokat és az összes függő csomagot, amelyekre már nincs szükség a rendszerben. A fenti parancs eltávolítja a gromacs csomaghoz társított összes konfigurációs fájlt és adatot.