Az alprogramok a parancsfájlokban speciális AppleScript-kód részeként léteznek a parancsfájlok végén. Ezek meg vannak nevezve, és parancsként működnek, amelyeket a parancsfájl bárhonnan kiválthat. Leggyakrabban alprogramokat hoznak létre egy olyan feladat kezelésére, amelyet egy szkriptben többször végrehajtanak.